거미의 몸은 크게 두 부분으로 나뉩니다. 바로 머리가슴(cephalothorax)과 배(abdomen)입니다. 이 두 부분은 가느다란 허리, 즉 '협부(pedicel)'로 연결되어 있습니다. 간혹 거미를 곤충과 혼동하여 몸이 세 부분(머리, 가슴, 배)으로 나뉜다고 생각하는 경우가 있지만, 거미는 곤충과는 다른 절지동물 문에 속하며, 그 특징적인 몸 구조는 두 부분으로 구별됩니다.
머리가슴 (Cephalothorax) 머리가슴은 머리와 가슴이 합쳐진 부분입니다. 이 부분에는 거미의 모든 다리(총 8개)와 눈, 그리고 입 주변의 기관(협치, 독선, 촉지 등)이 위치합니다. 겉으로 보기에는 머리와 가슴이 분리되지 않고 하나의 덩어리처럼 보이기 때문에 '머리가슴'이라고 불립니다. 이곳은 거미의 움직임, 감각, 먹이 섭취 등 생존에 필수적인 기능을 담당합니다.
배 (Abdomen) 배는 거미의 몸통 뒷부분을 차지하며, 소화기관, 생식기관, 그리고 거미줄을 만드는 방적기(spinneret) 등이 위치합니다. 배의 모양과 크기는 거미의 종류에 따라 매우 다양하며, 통통한 형태부터 길쭉한 형태까지 여러 가지 모습을 하고 있습니다. 배에는 또한 호흡을 위한 폐기공(book lung)이나 기관(trachea)이 존재합니다. 거미줄을 토해내는 방적기는 보통 배의 끝부분에 위치하며, 이를 통해 먹이를 잡거나 집을 짓고 알을 보호하는 등 다양한 용도로 거미줄을 활용합니다.
협부 (Pedicel) 머리가슴과 배를 연결하는 가느다란 부분을 협부라고 합니다. 이 협부가 있기 때문에 거미는 머리가슴과 배를 어느 정도 독립적으로 움직일 수 있으며, 이는 거미의 유연한 움직임에 중요한 역할을 합니다. 곤충의 경우 머리가슴과 배가 직접적으로 붙어 있는 것과 비교하면 거미의 특징적인 해부학적 구조라고 할 수 있습니다.